As enchentes no Rio Grande do Sul potencializaram a disseminação de doenças, em especial a Leptospirose. A transmissão dessa doença se dá por urina de animais contaminados, principalmente ratos. Pessoas que possuem lesões nas mucosas do corpo, ao entrarem em contato com água infectada de enchentes, possuem grande chance de contrair a doença.
O aparecimento dos sintomas possui uma janela de até 30 dias. Por isso, ainda há investigações sobre o número de mortes causadas especificamente pela Leptospirose. Até agora, 10 mortes são investigadas e há mais de 1.000 vítimas com suspeita de terem contraído a doença.